GBIF
Portail de données sur la biodiversité reliant observations, jeux de données et organismes contributeurs, avec des informations de provenance.
Ce visuel reprend le nom, le domaine et le logo du site. Consultez le lien officiel pour voir sa page actuelle.
Trouver des observations de biodiversité
Explorer occurrences, jeux de données et organisations contributrices.
Avant de vous appuyer sur le résultat : Examiner provenance, couverture et limites d’échantillonnage.
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Choisir le format qui conserve le contexte nécessaire
- Format simple
- Commencer par les champs courants.
- Darwin Core Archive
- Conserver davantage de données et métadonnées.
- Identifiez les champs nécessaires à votre question.
- Comparez format simple et archive Darwin Core.
- Vérifiez séparateur et définition des colonnes avant l’analyse.
Exemple fictif : un atelier importe un fichier GBIF et voit toutes les valeurs dans une seule colonne. Il vérifie le séparateur au lieu de supprimer les en-têtes. Pour son étude, il conserve aussi le contexte des données plutôt qu’un tableau extrait sans définition.
Votre trace utile : Format, séparateur, champs retenus et référence de l’extraction.
Un format correctement importé ne supprime pas les limites des observations.
Choisir une autre méthode commentée
Méthode éditoriale construite à partir de GBIF Technical Documentation — Download formats. Documentation consultée le . Les exemples sont des exercices fictifs, pas des résultats de test du service.
Comprendre une ligne d’occurrence
Une occurrence documente un taxon, un lieu et une date ; elle ne constitue pas automatiquement un comptage d’individus.
| Élément | Signification |
|---|---|
| occurrenceID | Identifiant de l’enregistrement. |
| basisOfRecord | Nature de la preuve, par exemple observation ou spécimen. |
| scientificName / eventDate | Nom scientifique et date de l’événement. |
| Incertitude géographique | coordinateUncertaintyInMeters indique une incertitude en mètres ; une coordonnée seule ne donne pas cette précision. |
| Quantité documentée | individualCount et organismQuantity décrivent des quantités ; leur absence ne vaut ni zéro ni un individu. |
Mettre le raisonnement à l’épreuve
Situation pédagogique. Deux lignes portent sur le même lieu et la même espèce. Peut-on immédiatement conclure à deux animaux ?
Lire l’explication
Non. Examinez la nature des enregistrements, leurs identifiants et les quantités documentées. Une ligne et un individu ne sont pas des unités équivalentes.
Documentation du tableau : GBIF — Occurrence data quality requirements · . L’exercice est un exemple pédagogique.
Garder la provenance d’un téléchargement d’occurrences
GBIF rassemble des données sur la biodiversité issues de différents fournisseurs. Un téléchargement d’occurrences doit être utilisé avec ses critères de sélection, ses métadonnées et son DOI. Contrôlez les champs de localisation, les dates et les indicateurs de qualité avant de compter ou cartographier les enregistrements.
- Données
- Occurrences et jeux de données de biodiversité.
- Téléchargement
- Formats documentés et référence DOI de l’export.
- Qualité
- Différencier champs d’origine et interprétations de GBIF.
- Décimales et incertitude
- Le nombre de décimales d’une coordonnée ne mesure pas à lui seul l’incertitude de localisation. Lisez la description du lieu, le référentiel et l’incertitude documentée avant d’utiliser le point pour une analyse à petite emprise.
- Localité et contrôle
- Comparez la coordonnée à la localité décrite et conservez les métadonnées de son géoréférencement. Un point placé précisément à l’écran peut provenir d’une indication historique large ; ne lui attribuez pas une précision de terrain absente de la source.
- Téléchargement simple GBIF
- SIMPLE_CSV fournit un texte séparé par tabulations, malgré son nom.
Source : GBIF Technical Documentation — Download formats · consultée le - Archive Darwin Core
- DWCA associe des tables de données et des métadonnées XML dans une archive.
Source : GBIF Technical Documentation — Download formats · consultée le
Un enregistrement est-il forcément une observation indépendante ?
Inspectez le type de donnée et les doublons possibles avant un décompte.
Pourquoi citer le DOI du téléchargement ?
Il identifie l’export utilisé ; les références des jeux sources restent utiles pour retracer la provenance.
Documentation du profil initial
Documentation du profil initial consultée le . Les repères ajoutés portent leur propre source et date de consultation ci-dessus.
